Kasama sa pharynx ang nasopharynx, oropharynx, at laryngopharyngeal. Ang mauhog lamad ng tatlo ay tuloy-tuloy at nabibilang sa upper respiratory tract. Nasopharyngeal swab at oropharyngeal swabs mayroon lamang iba't ibang sampling path. Ang oral sampling ay oropharynxpamunas, ang nasal sampling aynasopharyngeal pamunas. Gayunpaman, dahil ang oropharyngealpamunasay maaaring patakbuhin sa pamamagitan ng pagbubukas ng bibig, ito ay medyo simple, kaya ito ay mas karaniwang ginagamit sa clinically, ngunit ang panganib ng pagkakalantad ng sampler ay mas mataas.
Maaaring kunin ng bagong coronavirus pneumonia nucleic acid test ang pasyentenasopharyngeal swabs, plema at iba pang lower respiratory secretions, dugo, dumi at iba pang sample para sa pagsusuri. Para sa bagong coronavirus nucleic acid, kung positibo ang nucleic acid ng sample, makumpirma ang impeksyon sa virus. Pangunahing nakakaapekto ang bagong impeksyon sa coronavirus sa mga bronchial epithelial cells at alveolar epithelial cells. Ang mga specimen sa lower respiratory tract, tulad ng sputum at airway extracts, ay dapat gamitin hangga't maaari upang mas tumpak na maipakita ang impeksyon ng virus.